Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms