Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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