Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLCA4Q14CN2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCA4Q14CN2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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