Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms