Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN1Q14457 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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