Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR4Q13639 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms