Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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