Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TUBB3Q13509 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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TUBB3Q13509 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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TUBB3Q13509 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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