Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTA1Q13330 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTA1Q13330 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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