Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DCXR-202ENST00000577286 553 ntTSL 213.18□□□□□ -0.35e-13■■■■□ 22.3
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PABPC4Q13310 TCIRG1-212ENST00000530802 223 ntTSL 1 (best)21.97■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 TCIRG1-205ENST00000525724 1864 ntTSL 521.96■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 TCIRG1-210ENST00000530063 220 ntTSL 1 (best)3.27□□□□□ -1.892e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 RBM39-245ENST00000639702 5914 ntTSL 513.6□□□□□ -0.237e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 RBM39-223ENST00000463004 4580 ntTSL 513.3□□□□□ -0.287e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 RBM39-206ENST00000403542 2883 ntTSL 213.18□□□□□ -0.37e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.327e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 RBM39-202ENST00000338163 2792 ntTSL 212.75□□□□□ -0.377e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.727e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 RBM39-221ENST00000461283 2415 ntTSL 53.78□□□□□ -1.817e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.455e-10■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 330.27■■■□□ 2.449e-18■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 MACROD1-203ENST00000538595 868 ntTSL 329.78■■■□□ 2.369e-18■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.341e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.951e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 ICAM2-214ENST00000583684 892 ntTSL 524.02■■□□□ 1.444e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.444e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.375e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.355e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.065e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.974e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 ICAM2-211ENST00000581417 1114 ntTSL 521.14■□□□□ 0.974e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.894e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.894e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.84e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.84e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.785e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 TSSC4-208ENST00000467308 409 ntTSL 319.36■□□□□ 0.695e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 318.97■□□□□ 0.639e-18■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.434e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 SLTM-222ENST00000560494 674 ntTSL 314.28□□□□□ -0.129e-18■■■■□ 22.3
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PABPC4Q13310 SLTM-209ENST00000493062 987 ntTSL 212.62□□□□□ -0.399e-18■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 SLTM-212ENST00000557924 3021 ntTSL 212.27□□□□□ -0.459e-18■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.619e-18■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 SLTM-208ENST00000492526 3022 ntTSL 29.25□□□□□ -0.939e-18■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.746e-9■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 TPT1-209ENST00000528619 731 ntTSL 29.47□□□□□ -0.893e-13■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 SUMF2-219ENST00000531229 737 ntTSL 216.97■□□□□ 0.313e-9■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 PAM16-205ENST00000571986 606 ntTSL 320.85■□□□□ 0.934e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 219.43■□□□□ 0.74e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.684e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.594e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 PAM16-209ENST00000573614 650 ntTSL 518.13■□□□□ 0.494e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 PAM16-202ENST00000571178 353 ntTSL 317.62■□□□□ 0.414e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.184e-8■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.881e-12■■■■□ 22.3
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PABPC4Q13310 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.021e-17■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-17■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.581e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.211e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 SSBP4-203ENST00000593641 900 ntTSL 527.79■■■□□ 2.041e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 CCDC28B-203ENST00000461819 780 ntTSL 527.08■■□□□ 1.932e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.82e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.555e-10■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 GRN-205ENST00000586443 1557 ntTSL 321.14■□□□□ 0.977e-7■■■■□ 22.3
PABPC4Q13310 RPL6-211ENST00000552455 781 ntTSL 214.24□□□□□ -0.131e-57■■■■□ 22.3
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PABPC4Q13310 YPEL3-206ENST00000565479 865 ntTSL 522.8■■□□□ 1.241e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.181e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.121e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 YPEL3-212ENST00000570099 669 ntTSL 316.1■□□□□ 0.171e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 AC087380.1-204ENST00000418729 1026 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.044e-55■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.854e-55■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 AC087380.1-203ENST00000420726 752 ntTSL 56.87□□□□□ -1.314e-55■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 WDR18-205ENST00000590354 678 ntTSL 218.09■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 WDR18-207ENST00000591155 417 ntTSL 217.91■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.992e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 EPB41L4A-AS1-202ENST00000427306 1367 ntTSL 227.73■■■□□ 2.036e-12■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 EPB41L4A-AS1-203ENST00000442823 578 ntTSL 221.39■■□□□ 1.016e-12■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 EPB41L4A-AS1-204ENST00000508590 292 ntTSL 320.43■□□□□ 0.866e-12■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.36e-12■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DUS1L-204ENST00000542088 1040 ntTSL 322.15■■□□□ 1.143e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DUS1L-203ENST00000538833 1250 ntTSL 1 (best)21.21■□□□□ 0.993e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.93e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DUS1L-205ENST00000577574 473 ntTSL 517.79■□□□□ 0.443e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DUS1L-212ENST00000579854 657 ntTSL 217.03■□□□□ 0.323e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DUS1L-210ENST00000578846 4456 ntTSL 215.58■□□□□ 0.083e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.016e-16■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.994e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.754e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.614e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.424e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.131e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.041e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.441e-323■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.664e-9■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.674e-9■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.164e-8■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.324e-8■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 PIN1-204ENST00000586025 4022 ntTSL 216.84■□□□□ 0.294e-8■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 PIN1-209ENST00000590540 702 ntTSL 315.9■□□□□ 0.144e-8■■■■□ 22.2
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