Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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NR1H3Q13133 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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NR1H3Q13133 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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NR1H3Q13133 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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NR1H3Q13133 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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NR1H3Q13133 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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NR1H3Q13133 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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NR1H3Q13133 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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