Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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FOXD4Q12950 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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FOXD4Q12950 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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FOXD4Q12950 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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FOXD4Q12950 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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FOXD4Q12950 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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FOXD4Q12950 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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