Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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