Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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