Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN1BQ07699 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms