Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBQ06643 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBQ06643 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LTBQ06643 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LTBQ06643 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LTBQ06643 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBQ06643 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBQ06643 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms