Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms