Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ERCC6Q03468 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms