Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms