Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms