Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms