Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms