Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms