Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC1P62191 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMC1P62191 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMC1P62191 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMC1P62191 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMC1P62191 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC1P62191 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC1P62191 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms