Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms