Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERFP50548 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERFP50548 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERFP50548 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERFP50548 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERFP50548 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERFP50548 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERFP50548 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERFP50548 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERFP50548 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERFP50548 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERFP50548 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms