Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSEN1P49768 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms