Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A9P48067 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A9P48067 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms