Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IQGAP1P46940 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms