Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLH1P40692 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLH1P40692 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MLH1P40692 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLH1P40692 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MLH1P40692 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms