Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms