Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT2P35908 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT2P35908 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT2P35908 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT2P35908 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT2P35908 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms