Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA3P35244 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA3P35244 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA3P35244 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA3P35244 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA3P35244 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA3P35244 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA3P35244 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA3P35244 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA3P35244 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA3P35244 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA3P35244 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms