Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms