Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRABP1P29762 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms