Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms