Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD1P28340 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD1P28340 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD1P28340 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD1P28340 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD1P28340 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLD1P28340 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLD1P28340 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLD1P28340 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLD1P28340 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms