Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms