Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms