Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM1P13164 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms