Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms