Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms