Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms