Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP2C9P11712 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms