Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
POLA1P09884 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLA1P09884 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLA1P09884 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
POLA1P09884 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLA1P09884 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLA1P09884 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLA1P09884 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLA1P09884 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLA1P09884 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLA1P09884 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
POLA1P09884 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLA1P09884 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLA1P09884 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
POLA1P09884 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLA1P09884 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLA1P09884 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLA1P09884 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLA1P09884 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLA1P09884 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLA1P09884 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLA1P09884 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLA1P09884 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLA1P09884 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLA1P09884 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLA1P09884 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLA1P09884 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLA1P09884 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLA1P09884 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLA1P09884 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLA1P09884 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLA1P09884 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLA1P09884 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLA1P09884 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLA1P09884 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLA1P09884 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLA1P09884 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLA1P09884 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLA1P09884 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLA1P09884 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLA1P09884 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
POLA1P09884 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms