Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSLP07711 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSLP07711 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSLP07711 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSLP07711 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSLP07711 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms