Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA1P05813 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms