Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYF2O95926 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYF2O95926 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYF2O95926 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms