Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGPS1O95749 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGPS1O95749 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms