Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms